Славься, университет! : иллюстрированные страницы истории ТГУ /Нац. исслед. Том. гос. ун-т ; [авт. коллектив: Н. М. Дмитриенко, Э. И. Черняк, С. А. Некрылов и др. ; ред. совет: Э. В. Галажинский (председ.), Э. И. Черняк (науч. ред.) и др.]

Выявление и изучение новых источников по истории общественной жизни Сибири (конец XIX в. - 1920 г. ) : Законодательная деятельность белых правительств Сибири (июнь-ноябрь 1918 года) /Сост. Е. В. Луков, С. Ф. Фоминых, Э. И. Черняк; Том. гос. ун-т, Каф. современной отечественной истории Вып. 1

Выявление и изучение новых источников по истории общественной жизни Сибири (конец XIX в. - 1920 г. ) : Законодательная деятельность белых правительств Сибири (июнь-ноябрь 1918 года) /Сост. Е. В. Луков, С. Ф. Фоминых, Э. И. Черняк; Том. гос. ун-т, Каф. современной отечественной истории Вып. 3

Наука и образование в Томске. Материалы к энциклопедии Томской области : сборник /Том. гос. ун-т. ; Ист. фак. ; [сост. : С. Ф. Фоминых и др. ; редкол. : Э. И. Черняк (отв. ред. ) и др.]

Революция в Сибири: съезды, конференции и совещания общественных объединений и организаций (март 1917 - ноябрь 1918 года) /Э. И. Черняк ; Том. гос. ун-т, Проблемная науч.-исслед. лаборатория истории, археологии этнографии Сибири ; науч. ред. С. Ф. Фоминых Черняк, Эдуард Исаакович 1941-

Судьба регионального центра в России : (к 400-летию г. Томска) : [сборник] /Том. гос. ун-т ; [науч. ред. В. П. Зиновьев, С. Ф. Фоминых, Э. И. Черняк]

Томские музеи. Музеи университетов : материалы к энциклопедии «Музеи и музейное дело Томской области» /Том. гос. ун-т, Науч.-образовательный центр «Музей и культурное наследие» ; под ред. Фоминых С. Ф., Черняка Э. И.

Томские музеи : [сборник документов и статей] /под ред. С. Ф. Фоминых, Э. И. Черняка ; Том. гос. ун-т

Исторические исследования в Томском университете в постсоветский период. 1991-2017 гг. : [коллективная монография /В. П. Бойко, М. В. Грибовский, Л. В. Дериглазова и др.] ; науч. ред. С. Ф. Фоминых, В. П. Зиновьев ; Нац. исслед. Том. гос. ун-т